一、光解
　　施于植物及土壤表面的除草劑，在日光照射下會進行光化學分解，這種光解作用是由紫外線引起的，光解速度決定于除草劑的類型、品種和分子結構。紫外線的強度、除草劑分子對光的吸收能力及溫度等因素都是影響光解作用的因素。
　　大多數除草劑溶液都能進行光解作用，其吸收的是220-400nm的光譜；不同類型除草劑的光解速度差別很大，二硝基苯胺除草劑，特別是氟樂靈最易光解，其他各類除草劑光解速度稍慢。為防止光解，噴藥后應將藥劑混拌于土壤中。
　　二、揮發
　　揮發是除草劑特別是土壤處理除草劑消失的重要途徑之一，揮發性強弱與化合物 的物理特性、飽和蒸汽壓密切相關，同時也受環境因素制約；飽和蒸氣壓高的除草劑，揮發性強；二硝基苯胺類除草劑品種就屬于飽和蒸氣壓較高的一類，其次是硫代氨基甲酸脂類除草劑，這些除草劑噴灑于土表后，就會迅速揮發，喪失活性。其中揮發的氣體更容易傷害敏感作物。
　　在環境因素中，溫度與土壤濕度對除草劑揮發的影響最大：溫度上升，飽和蒸氣壓增大，揮發性越強；土壤濕度大，有利于解吸附作用，使除草劑易于釋放在土壤溶液中成游離態，故易汽化揮發。
　　三、土壤吸附
　　吸附作用與除草劑的生物活性及其在土壤中殘留與持效期有密切關系。除草劑在土壤中主要被土壤膠體吸附，包含物理吸附與化學吸附。
　　土壤對除草劑的吸附一方面決定于除草劑的分子結構，另一方面決定于土壤有機質與黏粒含量，脲類、均三氮苯類、硫代氨基酸酯類等許多類型除草劑在土壤中易被吸附，而磺酰脲類與咪唑啉酮 類 除草劑不易被吸附；土壤有機質與黏粒含量高的土壤對除草劑吸附作用強。
　　在土壤處理除草劑的使用中，應當考慮使土壤膠體對除草劑的吸附容量達到飽和，因此單位面積用藥量應隨土壤有機質及黏粒含量適當增減，也可進行灌溉，以促進除草劑進行解吸附作用從而提高除草劑效果。
　　四、淋溶
　　淋溶是除草劑在土壤中隨水分移動在土壤剖面的分布，除草劑在土壤中的淋溶決定于其特性和水溶度，土壤結構組成、有機質含量、PH值、透性以及水流量等。水溶度高的品種易淋溶，同時化合物的鹽類比酯類淋溶性強；土壤不同，導致其表面積差異很大，黏粒與有機質含量高的土壤對除草劑的吸附作用強，使其不易淋溶；反之，砂質土及沙壤土透性強，吸附作用差，故有利于淋溶。
　　土壤PH值主要通過影響吸附及除草劑與土壤成分進行的化學反應而間接影響除草劑的淋溶，磺酰脲類除草劑在土壤中的淋溶隨PH值上升而增強，故在堿性土中比酸性土更易于淋溶。
　　淋溶性強的除草劑易滲入土壤剖面下層，不僅降低除草劑效果，而且易在土壤下層積累或污染地下水。在利用位差選擇性時，由于淋溶使除草劑進入作物種子所在土層，易造成藥害，因此應根據除草劑品種水溶度及移動性強弱、土壤特性及其他影響水分移動的因素，確定最佳是要買方法與單位面積用藥量，以提高除草效果，并防止對土壤及地下水污染。
　　五、化學分解
　　化學分解是除草劑在土壤中消失的重要途徑之一，其中包括氧化、還原、水解以及形成非溶性鹽類與絡合物。磺酰脲類除草劑在酸性土壤中就是通過水解作用而逐步消失的。當土壤中高價金屬離子Ca2 、Mg2 、Fe2 等含量高時，一些除草劑能夠與這些離子反應，形成非溶性鹽類；有的除草劑則與土壤中的鈷、銅、鐵、鎂、鎳形成穩定的絡合物而殘留于土壤中。
　　六、生物降解
　　除草劑的生物降解包括土壤微生物降解與植物吸收后在其體內的降解。
　　微生物降解是大多數除草劑在土壤中消失的最主要途徑。真菌、細菌與放線菌參與降解。在微生物作用下，除草劑分子結構進行脫鹵、脫烷基、水解、氧化、環羥基化與裂解、硝基還原、縮合以及形成軛合物，通過這些反應使除草劑活性喪失。
　　土壤濕度、溫度、PH值有機質含量等顯著影響除草劑的微生物降解，適宜的高溫與土壤濕度促進降解。不同地區，必須深入了解除草劑的講解速度與半衰期，以便合理使用并正確安排后茬作物。
　　被作物與雜草吸收的除草劑，通過一系列生物代謝而消失，這些代謝反應包括氧化、還原、水解、脫鹵、置換、羨化、環化、同分異構、環裂解及結合，其中主要反映是氧化、還原、水解與結合。