自1994年新疆維吾爾自治區地方稅務局成立以來,承擔著新疆166萬平方公里的征收管理工作,主要征收營業稅、企業所得稅、個人所得稅等13個稅種。全區地稅系統下設19個地州市地稅局(不包括直征局和稽查局),86個縣(市、區)地稅局,其他直屬派出機構22個,294個基層稅務所。
2018年6月15日,國家稅務總局新疆維吾爾自治區稅務局在烏魯木齊市掛牌成立,原新疆維吾爾自治區國家稅務局、新疆維吾爾自治區地方稅務局正式合并。
烏魯木齊市地稅局、伊犁哈薩克自治州地稅局 、昌吉州地稅局、阿克蘇地區地稅局、、阿勒泰地稅局、巴音郭楞蒙古自治州地稅局、博爾塔拉蒙古自治州地稅局、克孜勒蘇柯爾克孜自治州地稅局、克拉瑪依市地稅局 、石河子地稅局、圖木舒克市地稅局、圖木舒克市地稅局、五家渠市地稅局、哈密地區地稅局 、塔城地區地稅局、吐魯番地區地稅局、喀什地區地稅局、和田地區地稅局、圖木舒克市地稅局、圖木舒克市地稅局、五家渠市地稅局、米東區地稅局。
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