關于1997年1月巨人集團危機出現時的資產、負債狀況，史玉柱在復出之后向媒體作了詳細說明：
　　我先說負債：香港1億樓花，國內5000萬的樓花，這是1.5億。然后是經營中的負債，有幾種，一種是當時生產保健品的原料供應商，其中一種是我們拖欠人家的，還有的是進二結一的，就是把下筆原料給我，把上筆原料結清，當時行規，一般都是這么做的。
　　這樣累積起來——因為還有些其他的，包括電腦，這一塊有1億左右。這樣負債一共是2.5億。
　　我的資產是這樣的：巨人大廈，審計結果是1.7億，當然什么都在里面了。土地的錢，我們是交清的；設計費，1000多萬港幣；工程費。
　　還有一塊資產，我們有1萬平（方）米的辦公樓，是自己的產權，這一塊連買帶裝修，花了5000多萬。這已經是2.2億了。
　　我們還有3億多的應收款。
　　一般運作，我跟原料供應商是進二結一，我跟代理商也是進二結一。正常情況下，這個問題暴露不出來。
　　3億應收款里面有1個億是進二結一，一直信譽很好的，不會出問題；另外兩億跟管理相關，討起來是有難度的，不能全部討回來，但力度大一點，打打官司，就能多回來一點。
　　這樣一算，我的資產從賬面上看并不是太差的。
　　媒體一說巨人破產后，情況就變化了，你欠別人的，一點都賴不掉了，人家都追上來了；別人欠你的，他以為巨人破產了，不給你了，至少他跟你拖，而這個債務只要拖滿兩年，*（從）法律上（講）你就不能追了。
　　所以應收款這塊就掉了。
　　但是那時候的史玉柱已如一頭困獸，他稱：
　　那個時候困難呀，我們連打官司的錢都沒有了。打官司要先交一筆錢。
　　危機來臨之時，史玉柱只有兩個選擇：
　　一是破產，但是破產政府是不會同意的，因為巨人當時的知名度是非常大的，現在可能體會不到，（當時）珠海最出名的企業就是巨人，如果巨人破產了，那對珠海的投資環境是有很大影響的，所以我們跟政府官員談（破產），政府不同意，說破產的事不能談。因此我們后來就沒有走破產的路，但是我們也救活不了，就說拖著吧，也只有這條路了，一拖著，我們也就沒什么事干了。
　　對于“提請巨人破產”這個問題，史玉柱表示：
　　關于破產，我想強調一點，即使巨人破產，我個人也要還老百姓這個錢。曾經有債權人想提請破產，后來又沒有提。因為巨人就剩個巨人大廈，進入破產程序大廈就要拍賣，拍賣是拍不出多少錢的，因為全要現金，再扣掉律師費，他一算拿不到多少錢。
　　史玉柱信誓旦旦地說：“即使巨人破產，我個人也要還老百姓這個錢。”當時，這句表白早已被外界的各種聲音淹沒，沒人相信他能還得起這筆錢。
　　我第二次匆忙創業抱的最大目的就是要還錢，把舊債還清。創業時期，我就跟手下的人講，我們最大的目的就是還錢，這老百姓的錢我一定要還，我現在年紀還不算大，還想再做點事，不愿一直背著這個污點，除非我自己將來甘心只當一個小老板。
　　對于有媒體說，“從法律的角度看，史玉柱應該承擔所有的債務”。針對這種說法，史玉柱澄清說：
　　巨人是1992年注冊（的），那時還沒有公司法，所以也就沒有有限責任這個詞。那時我不是公司股東，以前的企業是集體所有制注冊，集體所有制企業跟我沒有什么關系。不過在1996年的時候，我以個人的名義把股份從當地政府買了過來，這才成為有限責任公司。既然是有限責任公司，進入破產程序，按法定的程序，公司破產以后，公司的債務，我的確可以不還。當時公司注冊資金只有2225萬（元）。企業破產的方式有兩種，一個是債權申請，另一個是股東申請，按規定必須受理，我們沒有提出任何申請。當時真正的股東有3個。
　　2000年8月26日，沉寂多年的史玉柱首次亮相于《對話》欄目。“重出江湖”的史玉柱上來的第一句話就是：一定要償還老百姓的血汗錢。
　　2001年2月，史玉柱開始還債。
　　當時我有個10年計劃。10年之內還清老百姓的錢，一年攢1000萬（元），至于說能否提前我心里有底，但提前多長時間我不知道。
　　原央視著名主持人方宏進曾問過史玉柱這樣一個問題：“很多人都在猜，你是當初跌到谷底時就已經下定決心要還錢，還是等到腦白金賣到一定程度，覺得有能力還了，才開始還錢的？實話實說。”史玉柱在深思了一會兒之后回答說：
　　我1997年夏天時是最胖的，當時巨人救不活了，人非常輕松，精神最好，還錢是我公開承諾過的，但那時候沒有時間表……后來腦白金做起來了，我才開始考慮錢什么時候還的問題。
　　同時，史玉柱表示，還錢時并沒有擔心賺得還不夠，他表示：
　　腦白金1999年已經有相當規模，但是那個時候我們還相當低調，實際上我們著手還錢的時候，手邊已經有那么多錢了，當時把這筆錢從公司里抽走，公司（還）能照常運轉。
　　在《對話》欄目中，企業界的女強人張樹新對史玉柱的還債做法給予了極大的肯定，她說：“財富沒有良心，人才有良心，假如人們今天賺錢一定要犧牲良心才能獲取財富的話，那么財富就一定有原罪。如果我們再去賺錢的話，一定是在良心和財富之間作了一個平衡。”
　　腦白金的“滋補”
　　2001年，在還錢后，有媒體曾向史玉柱發問，還老百姓的這15億的錢具體是從哪里來的，史玉柱也沒有保留，他坦率地說：
　　4000萬元是向上海像谷集團呂抬濤借的，11億是上海健特公司做腦白金的利潤。上海健特公司一下子支出這筆錢，應該承認目前資金很緊張。
　　而當時，腦白金問世才兩三年，能有這么多的積累？史玉柱的回答是：
　　今年（2001年）1月份，腦白金銷售額超過2億元，也許創造了中國保健品市場單一品種月銷售額紀錄。去年（2000年），腦白金銷售了13億元，繳納稅款12億多。不久前徐匯區表彰“納稅大戶”企業，做了一批水晶玻璃“百萬元納稅企業”、“千萬元納稅企業”的獎牌，沒有做“億元納稅企業”，頒獎時，有人開玩笑說，上海健特公司恐怕應該領12只水晶玻璃獎牌了。
　　巨人大廈“倒塌”后，史玉柱雖然痛苦，但不茫然，他把自己關在辦公室里，一直在不停地思考。
　　我熟悉的領域就兩個，一是電腦，二是生物工程。電腦業那個時候要白手起家已經很困難了，投入很大，而且銷售額也許容易做起來，但利潤很難做起來。
　　我將來想定位在生物制藥上，非處方藥。我們現在已經在著手這一領域的研發，包括一些尖端的領域，比如基因。我們的特長有兩個，一個是營銷策劃還說得過去，另一個是還有待進一步建立的，就是研發。
　　當時，史玉柱的一位老領導來看他，問他的打算，他清清楚楚地告訴對方，自己想繼續從事保健品行業。這位領導并不認同，他認為史玉柱可能是太想還債，以至于昏了頭。因為在當時，中國的保健品市場上已經有眾多知名品牌，人們都認為這個市場已經飽和。但史玉柱堅持了自己的意見。當年，在深入調查的基礎上，他得出的結論是，中國的保健品市場遠未飽和。
　　當初巨人失敗的時候，很多人都說我們不該放棄IT去搞生物制藥，可是現在我和IT界的企業家聊天，沒有一個說我走錯路的。
　　對于生物科學的價值，史玉柱認為：
　　生物技術發展的速度很快，有很多機會，就看誰把握得住。現在基因還很神秘，可能3年后，生活中就有基因技術形成的產品了。我們很難跟國外大公司全方位競爭，但是可以集中火力，尋求局部突破。中國并不缺人才，缺的是錢，而基因研究不需要多龐大多昂貴的設備。前不久中國人在武漢做的基因測序，并不比國外差。我們也不排除合作、購買的方式，但你一定要介入，一定要懂，才能發現和把握它的商業價值。
　　我并不參與研發的具體環節，但需要把握研發成果的商業價值。我過去不懂基因，可以學，我們聘請了基因博士，跟他們學。半路出家不是問題，電腦我也是半路出家，我大學學的是數學，研究生學的是軟科學，沒有專門學過電腦。
　　事實上我鉆研基因差不多（有）兩年了。
　　當時，盡管史玉柱已負債2億多元，可他的兜里還有一張牌，那就是腦白金。巨人危機爆發之后，巨人集團在全國的分公司和營銷網絡都迅速瓦解。但是巨人在美國的公司還沒有受到影響，負責研發的是史玉柱的大學同學袁彬，也就是當初為史玉柱開發腦黃金的人。1997年8月至9月，在美國研發的新產品腦白金進入攻堅階段，1998年上半年研制成功。直接生產后，馬上就可以投放市場。
　　史玉柱將市場的重點放在了華東，他認為：巨人集團和他史玉柱個人在珠海的信譽已經喪失，要在珠海建立根據地那是不可能的；華東地區本身就是一個大的市場，并且具有很廣泛的輻射作用；另外，華東地區人們的生活水平都比較高，因而那里的人們對保健品更容易接受；再者就是因為當年的腦黃金在華東地區的銷售不錯。
　　1998年，史玉柱分別在上海和珠海注冊了公司。“因為要對全國市場做調研，史總也沒有辦公室，自己拿了一個小箱子，把它作為移動的辦公室。”巨人集團副總裁程晨回憶說。
　　新公司的思路和產品來源都已經有了，就是缺乏資金。
　　至于啟動資金，2001年，史玉柱在接受媒體采訪時說：
　　離開珠海的時候，真的是一貧如洗。這之前手機已經不用了，交不起話費。直到去年（2000年），我才重新用上手機。我們的人出差主要是坐火車，坐硬座。工資也非常低，有一段時間，我們的副總經理，月工資也就是幾百塊錢。這兩年如果要回顧的話，主要就是一個字：苦，比1989年剛剛出來創業時還要苦，那個時候苦是苦，（但）沒有心理負擔。
　　離開珠海的時候，新公司的思路包括產品來源都已經有了，但是沒有錢。
　　史玉柱從朋友那里借了50萬元作為啟動資金，把借來的錢作了如下分配：先拿出5萬元，給幾十個一直跟隨著他的工作人員補發了拖欠的工資，穩定軍心，鼓舞士氣；15萬元給了無錫一家公司用于生產腦白金；留出15萬元做預備資金；剩下的15萬元全部砸向了江蘇省江陰縣。
　　啟動資金就是這么來的。剛開始我們做得很小，就做江蘇一個縣。兩個月后打開了市場，有了一點利潤，就做下一個地方，就是這樣一點點滾出來的。到現在，除了廣東、北京，內地其他省份都在做了。我們一直是合作生產，到后來我們收購了江蘇一個地方負債率很高的藥廠，才有了自己的生產線。現在公司的銷售額旺季的時候是千萬元的量級。
　　史玉柱每次談到巨人的復蘇，都會提到“江陰調查”。在他看來，“江陰調查”是巨人危機后的一個分水嶺，他從那個時候起對巨人的東山再起有了信心。
　　“腦白金”推出來之后，迅速風靡全國，到2000年，月銷售額達到1億元，利潤達到4500萬元。史玉柱在全國建立起了擁有200多個銷售點的龐大銷售網絡，規模超過了鼎盛時期的珠海巨人集團。
　　在腦白金的“滋補”下，巨人奇跡般地活了過來。然而，市場上成功的腦白金還是遭到了輿論的圍剿，史玉柱也再次遭受業界非議。不過，這一切并未影響腦白金在市場上的持續走俏。