由于冬季棚室內濕度比較大，空間又小，空氣流通不暢，重茬、迎茬現象嚴重，所有這些對棚室蔬菜病蟲害的發生和流行都十分有利。特別是蔬菜定植后，病蟲害發生后防治效果不佳。這主要是因為：
　　1、棚室內空間小，噴霧效果不佳。
　　2、隨著藥量濃度的不斷加大，病菌和害蟲抗藥性增強，防治成本也增加，蔬菜污染將更加嚴重。
　　冬季棚室蔬菜定植后，發生的主要病害有：黃瓜霜霉病、角斑病、炭疽病、白粉病、黑星病、菌核病；番茄葉霉病、灰霉病、疫病、青椒炭疽病等。主要蟲害有：蚜蟲、紅蜘蛛等。
　　針對以上病蟲害的發生特點，冬春棚室蔬菜進行病蟲害防治時，應采取以下三種方法：
　　一、藥水定植：　　用90％的乙磷鋁500倍液加70％的甲基托布津1000倍液或25％的多菌靈500倍液進行定植灌根，可有效地防治多種病蟲害的發生和危害。
　　二、應用煙劑：　　應用近年來研制開發的新藥棚菌靈和棚蟲靈煙劑。該藥粉通過加溫后，由固體變為氣體狀態，緩慢漂浮、彌漫，充滿棚室空間，均勻地沉積在蔬菜各個部位。同時，施放煙劑還可以降低棚室內的空氣濕度，減少蔬菜葉片上夜間的結露量，減少蔬菜葉片上病菌孢子的發芽量，起到生態防治病害的作用，且80％以上的煙劑飄落到蔬菜表面上，有利于充分發揮藥效。
　　棚菌靈煙劑可防治多種病害，主治黃瓜霜霉病、白粉病、炭疽病、黑星病，兼治番茄疫病、葉霉病、斑枯病等多種真菌性病害，其防治效果比常規噴霧施藥法高20％，每畝（667平方米）可增產蔬菜1000公斤。
　　棚蟲靈煙劑是一種蟲、病雙治的煙劑新品種，對害蟲殺滅速度快、效果好。對蚜蟲防治效果可達98％以上；對白粉病的防治效果可達90％以上。
　　三、應用粉塵劑：　　粉塵劑就是把固體農藥研磨成很細的、能通過300目以上細篩的藥粉，用噴粉器噴粉，使農藥在棚室內形成飄塵每次每畝（667平方米）噴施粉塵劑1公斤左右。即使在棚室密閉不嚴的情況下，粉塵也能滯留在棚率內，均勻沉積在蔬菜的各個部位，起到煙劑一樣的效果。粉塵施藥法防治效果可比常規的噴霧施藥法提高40％以上。
　　目前，我國粉塵劑定型的產品有百茵清粉塵劑、敵托粉塵劑、脂銅粉塵劑和滅克粉塵劑等品種。