1、用藥時機把握不準：
　　打藥必須抓住時機，只有了解病蟲草害的發生規律，適時用藥，方能奏效。比如治螟蟲，必須在卵孵高峰期用藥。如果等到蟻螟已蛀入莖稈，出現了枯心、白穗、死穗等現象后才用藥，則肯定防效不佳。
　　2、施藥方法不當：
　　田間病蟲草害的發生和害蟲的棲息，在作物上都有一個為害部位。這個特定的部位，就是我們所用農藥這支“箭”應該射中的“靶”，射不中靶， 農藥防效就差。如防治螟蟲只有對準水稻心葉噴藥，效果才好。
　　3、病蟲草抗性增加：
　　病菌、害蟲及雜草對農藥的抗性，是阻礙農藥充分發揮應有防治效果和潛在效能的現實問題。隨著農藥用量的迅速增加和品種的不斷更替， 病蟲草抗藥性也日趨加劇， 特別是糧、油、菜、茶、果等主要作物，用藥頻繁，病蟲草抗藥性更是幾倍、幾十倍的增加。
　　4、防治對象不明確：
　　病當蟲打、蟲以病殺、草做蟲除，這種現象普遍存在。這首先是診斷錯誤，判別不清，導致錯誤用藥。如棉花現蕾后發生的紅葉枯病， 葉脈變綠， 葉肉紫紅呈豬肝色， 葉片向下反卷， 最終焦枯脫落，人們常誤認為是紅蜘蛛為害。大豆田雜草菟絲子為害， 導致大豆生長停滯，發育不良，有的人常當成根結線蟲病來治，等等，當然是越治越嚴重。
　　5、噴施藥液浪費大：
　　目前， 我國農村普遍使用的噴藥器具，仍是幾十年一貫制的工農型噴霧器，費勞力、浪費大、易中毒、不安全、霧粒粗、防效差。據測定，這種噴霧法，黏著性差，沉積率低，其中的藥液不僅白白浪費了，而且藥液滴落在土壤里，流失在水域中，還嚴重污染了環境。所以，應積極推廣低容量噴霧、超低量噴霧、彌霧、靜電噴霧等新的機具和技術， 這是解決防治效果差、減少農藥浪費的有效途徑。
　　6、農藥自身的局限：
　　有些農藥對某些病蟲草害有良好的防治效果， 但對另一些病蟲草害卻無能為力，防效極差。如三唑磷對稻螟、棉鈴蟲和其他鱗翅目類害蟲防效較好， 而且有明顯的殺卵作用。但它卻能刺激稻飛虱產卵，導致稻飛虱再度猖獗。
　　7、施藥時間未把握好：
　　病、蟲及草害的發生有一定的規律也有自己的生物鐘。如菜粉蝶、菜青蟲成蟲、棉大卷葉蛾、稻蝗等都喜歡在光照充足的白天活動， 而鱗翅目夜蛾和部分螟蛾科害蟲都是在晚上活動、交配、產卵。因此，只有掌握害蟲的活動規律，在一天中，分不同時間有針對性地“按時服藥”，才能達到最佳的防治效果。
　　8、天氣條件的制約：
　　農藥的防治效果與不同的天氣條件有關，不同的溫度、濕度、光照、風力、陰晴等對病蟲的發生、活動規律和防治效果都有影響。如氣溫在8℃以下，除草劑不易發揮藥效； 在35℃以上的高溫和強烈光照下， 化學農藥易蒸發散失；風大藥液易飄移、吹散，也影響防效。施用乳油型農藥，噴藥時要求24 小時內無雨；施用觸殺性農藥，要求48 小時內無雨。
　　9、天敵的減少：
　　由于過去連年大量施用高毒、劇毒、高殘留農藥，在殺滅害蟲的同時也殺傷了害蟲的天敵， 使生態平衡受到破壞， 導致害蟲更加猖獗，形成惡性循環。
　　10、兌藥水質使用不當：
　　水有硬水和軟水之分， 一般井水、礦區水、某些山區的泉水多為硬水，稀釋農藥效果差，因這種水內含礦物質， 會分解農藥的有效成分。而塘水、河水、溪水多為軟水，礦物質含量少，稀釋農藥效果好。但這些塘水、河水，如果很渾濁，也會影響藥效的發揮。