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纖毛蟲病是蝦蟹類養殖中嚴重疾病之一，纖毛蟲影響對蝦的攝食、脫殼和生長，輕則對蝦吃料減慢、對蝦生長停滯；重則對蝦出現爬沙爬邊，時期長起慢性腸炎，在蛻殼期間出現零星偷死；嚴重時引起繼發性細菌感染可導致對蝦大量死亡。
纖毛蟲靠攝取水中的有機營養物質生活，適于在受有機質污染的水域中繁衍。在清新、無有機質的水中，纖毛蟲則得不到充足營養，生長繁殖被抑制，繼而死亡。
蝦養殖中常見的纖毛蟲一般是以細菌或有機碎屑為生，并不會入侵到對蝦的器官或組織，僅僅是寄生在對蝦的體表、鰓部，和對蝦共棲，可是這個共棲寄生過程往往就可能會給對蝦帶來許多負面的影響。纖毛蟲可以寄生在對蝦的各個生理階段，在對蝦寄生的纖毛蟲數量不多時，肉眼看不出癥狀，危害也不會太嚴重，在對蝦換殼時就可以擺脫纖毛蟲。但寄生數量太多了，就會帶來對蝦脫殼不遂、并發感染其他生物等等嚴重的癥狀。對蝦纖毛蟲感染嚴重時肉眼都可以看到，對蝦的游泳足發黃、發紅，鰓部變黑，也就是養殖戶說的黑鰓。但是洗一洗后用顯微鏡看對蝦的鰓組織，對蝦的鰓部并沒有變黑，表明那些黑東西是附著物。這些附著物可能會阻礙了對蝦的呼吸，影響了對蝦正常換殼等等生理現象，嚴重的發生缺氧浮游或者打轉的浮游，甚至窒息死亡。纖毛蟲感染很嚴重的時候甚至可以看到對蝦體表面有一層灰黑色絨毛狀付著物，也就是養殖戶常說的掛臟現象。感染纖毛蟲的蝦一般都都會表現出活力差，攝食能力降低，生長發育停止，不能正常換殼等等，如果不及時控制纖毛蟲的寄生這些癥狀會變本加厲，結果會引起對蝦的異常更加嚴重甚至大批死亡。
池塘纖毛蟲的出現表明，這個池塘的有機腐敗物、細菌（包括所有類型的細菌）太多了，這些是在沒有排污設備的*池、已經投料比較多的養殖中后期很難避免的現象，在濫用微生物、糖漿的蝦塘可能會更加明顯。纖毛蟲等等寄生蟲這些微型動物是通過攝取水體中的有機碎屑、細菌、浮游植物及其它固體有機物為生，是污染嚴重的水體自凈主力軍，養殖水體中的纖毛蟲等等寄生蟲越多，就是表明養殖水體的有機污染越嚴重。盡管纖毛蟲等等寄生活動越旺盛、越多，就表明池塘水的自凈能力越強，水質會容易凈化，但是纖毛蟲等等的寄生蟲對許多養殖品種都有害無益，所以要降低纖毛蟲的感染率首先就必須降低池塘的有機污染。可采取降低底泥、水體有機物（也就是為底泥、水體減肥）來控制纖毛蟲泛濫。
纖毛蟲發生的主要原因：
1、沒有定期改底，飼料、肥料、殘餌糞便等在池塘底部越積越多，底部缺氧發臭，此時易生纖毛蟲。
2、經常使用膏狀肥水產品肥水，肥水快速，水色往往綠爽、好看，但是由于可以被纖毛蟲攝食的小型藻類大量繁殖，會造成纖毛蟲大量發生，同時造成水體有機污染物過多，水體溶氧偏低，水質惡化滋生纖毛蟲。
3、使用絮凝劑改底，致使過量有機質淤積池底，引發纖毛蟲繁殖。
4、水變或倒藻后沒有正確及時改底。
5、對蝦養殖密度過大時也易發纖毛蟲病。
纖毛蟲預防措施：
1、穩定水體，加快有機質分解，減少污染。
2、多增氧。增氧是池塘生物生存的前提，很多微生物必須在溶氧充足的條件下才能才能生存。
3、勤改底。改底的同時能很好的預防纖毛蟲病的發生。
4、水體環境變化時，及時使用補鈣抗應激，脫殼時促進蝦迅速硬殼。好的體質，本身就可以抵抗纖毛蟲的侵害。
判斷纖毛蟲在對蝦身體上寄生方法：
1、水質：水質渾濁、透明度及水色給人感覺矇矇眬眬不清爽，調水、肥水不爽不起，可懷疑對蝦有可能寄生纖毛蟲；或水“寡”藻類單一的水體也易起纖毛蟲。
2、對蝦一段時間不能加料，蝦體粗糙，起料臺快離水時側看甲殼有熒光，腳黃、鰓黃，則有可能起纖毛蟲，盡快鏡檢以確定。
3、吃料正常蛻殼期間出現零星偷死，一般凌晨發現偷死，下午沒有，兩三天后偷死情況消失，在可能是纖毛蟲寄生少量蝦導致對蝦蛻殼不遂。
纖毛蟲的處理方法：
1、促蛻殼：小蝦，體質較好，無其它病癥、吃料正常，纖毛蟲寄生不嚴重的情況下采用此方法：一般上午改底，同時進適量的外源水，下午補鈣或可促進對蝦大量蛻過殼。
2、殺滅：原則大量蛻殼期間不殺、天氣不好盡量不殺、對蝦其它病癥高于纖毛蟲對對蝦的影響不殺、對蝦有期它病癥慎殺、對蝦體質差慎殺、藥物選擇經適當，殺蟲時要注意增氧防應激。殺蟲情況比較復雜，能不殺盡量不殺。
不建議殺纖毛蟲的原因：
1、如果是選擇殺纖毛蟲，纖毛蟲可能會殺下來，但水體也被殺的更加惡化，加速了纖毛蟲反彈。
2、通過改底驅除底部蟲卵，降低水底中的纖毛蟲，并內外補充鈣源，加速蝦子蛻殼生長，這樣既從根本上降低了水底中的纖毛蟲數量，減少了附著的機會，也通過蛻殼蛻掉體表纖毛蟲，促進蝦子快速生長。
對蝦是纖毛蟲類的主要宿主。纖毛蟲吸附在對蝦體表、鰓絲等部位，如果對蝦身體健壯，能正常脫殼，則寄生的纖毛蟲亦隨之脫掉，于對蝦無影響。因此在溫度適宜，池中有機營養物質豐富且又有宿主存在時，纖毛蟲以有性和無性方式大量繁殖。特別在大風、悶熱、暴雨過后，池底剩余有機質被翻起，纖毛蟲在一到兩天大量繁殖導致對蝦出現異常。
