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紫菜的種類較多，但種問雜交研究卻較少，而且目前也幾乎沒有在生產中應用的雜交種。其原因主要有兩個：一是多數栽培種類的紫菜葉狀體力雌雄問體，在雜交的過程中必須避免自體受精，與海帶等雜交相比有一定的難度;二是紫菜葉狀體的核相是單相的， 一些遺傳的優良性狀難以通過雜交表現出來。因此，國內外普遍采用選擇育種的方法進行紫菜育種。目前進行人規模生產的新品種主要有大葉甘紫菜、奈良輪條斑紫菜、長葉形條斑紫菜等。
(一)大葉甘紫菜
1962年日本愛援縣西條市的玉律漁業協會的漁民從甘紫菜群體中經多次選育，培育出的紫菜新品種，其持點是藻體大而薄、體形紉長、皺折多而淺呈青綠色，長度為如—120cm。該品種具有出苗早，生長速度快，抗白腐病能力強，單袍子故散量大等優點，適宜在內灣和河口附近海區栽培，產量較高。缺點是果袍子囊數量少，采果孢子比較困難。
(二)奈良輪條斑紫菜
1965年日本干葉縣奈良輪漁業協會的漁民從條斑紫菜中選擇的長葉形個體經篩選、分離培育而成，是條斑紫菜的一個變種。其藻休細長呈倒披針形、茶紅色皺折多而深.長度40—60M，具有出苗早，幼苗期單袍子放散數量大，抗病能力強，產品質量好等優點，適宜在外悔區栽培，產量較高。缺點是果孢子形成的數量少。
(三)長葉形條斑紫菜
是我國江蘇省啟東縣從條斑紫菜群體中選擇出的長葉個體，經過自交培育出的新品種。該品種藻體細長形，具有生長速度快，產量高，果孢子囊形成面積小，質量好的優點，經推廣可提高產量10%以上。
以上這三種紫菜各有特點，育種方法也不同，大家可以根據自己的實際情況來選擇育種方式。
