結構雷同
網絡上有很多免費使用的建站模板，誰都可以使用，這就容易導致網站的同質化嚴重，沒有顯示出企業的行業特征和企業形象特征，沒有給用戶留下深刻的印象。，一方面這樣影響了客戶對企業的好感，不利于企業品牌和形象的建設。
功能簡單，不容易升級
使用模板構建的網站不能靈活擴展網站的功能，從而增加了后期維護的難度。該網站使用的代碼很舊，有很多漏洞，容易被黑客利用。
程序功能方面
模板網站提供客戶許多功能模塊供選擇，但是這些功能模塊的功能都是已經事先定義好的，一般不能定制修改。而定制網站將每一個程序功能都是根據客戶的具體要求和差異化要求開發的，后期方便修改。
不利于搜索引擎優化
在某種程度上，模板的建立將影響網站的收集和排名。搜索引擎在搜索引擎蜘蛛中爬行。如果一個網站是使用模板構建的，那么網站的代碼和結構將非常相似，導致高重復率。然而，搜索引擎喜歡新事物，所以結構上的相似性很不利于優化排名。如果相似性很嚴重，搜索引擎會自動忽略掉它。
設計開發時間上
模板網站 提供給客戶許多可供選擇的網站設計模板，網站欄目框架和結構基本不變。用時短。
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