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一、家庭因素：患兒的父母文化水平大多較高，父母性格較內向，對子女冷淡和固執，家庭缺少溫暖;很多家長都忙碌于工作，對孩子的關心自然而然就少了很多，而且現在大部分孩子都屬于獨生子女，缺少家長的照料，他們都只能生活在自己的圈子，長期處于孤獨，容易舍得他們缺乏溝通能力，進而引發自閉癥。
二、遺傳的因素：1991 年Folstein 和 Piven報道孤獨癥的單卵雙生子同病率為82%，雙卵雙生子同病率為10%。Bolton等(1994年)發現孤獨癥家系中孤獨癥患病的負荷度增加，孤獨癥同胞及雙親的存在類似的認知功能缺陷和特定的人格特征，這些都表明孤獨癥的發病存在遺傳學基礎，進一步研究發現孤獨癥不符合單基因遺傳的特征，多基因遺傳的可能性較大。在20%的自閉癥者中，他的家族可找到有智能不足、語言發展遲滯和類似自閉癥的。此外，自閉癥男童中約10%有染色體脆弱癥。
三、懷孕期間的病毒感染：婦女懷孕期間可能因麻疹或流行性感冒病毒感染，使胎兒的腦部發育受損傷而導致自閉癥。
四、新陳代謝疾?。喝绫酵虬Y等先天的新陳代謝障礙，造成腦細胞的功能失調和障礙，會影響腦神經訊息傳遞的功能，而造成自閉癥。
五、腦傷：包括在懷孕期間窘迫性流產等因素而造成大腦發育不全，生產過程中早產、難產、新生兒腦傷，以及嬰兒其因感染腦炎、腦膜炎等疾病造成腦部傷害等因素，都可能增加自閉癥機會。
六、孩子心智都不成熟：在經歷一些傷害還打擊之后，如果沒有及時進行正確的開導、勸解，他們很容易鉆牛角尖，認為社會就是如此，而害怕進入群體生活，這也是導致孩子自閉癥的原因。
七、生化因素：自閉癥患兒的多巴胺、5-羥色胺可增高，血漿中腎上腺素和去甲腎上腺素增高、阿片等神經遞質異常，但缺乏特異性;腦組織發現小腦部位有神經細胞遷移的異常，浦肯野氏細胞數量的減少。另有研究報告自閉癥可能與大腦邊緣系統、杏仁核、海馬回有關。還有研究認為自閉癥與其出生后第一年內的腦生長速度過快有關。
八、生物學因素：患兒具有圍生期損害史者較正常出生嬰兒多，包括先天性風疹、巨細胞病毒感染、早產、難產、產傷、窒息等。自閉癥患兒發生癲癇者較多 (10%-15%)，腦電圖多有異常。
